CLIENT DOCUMENTATION
从设备安装、文件关系和Hi-C处理方法进入文档。
先确认系统、处理器架构、安装来源、目录权限和项目角色，再建立正式连接。
FASTQ、BAM、BAI、BED、HDF5、样本清单和配置文件应按角色成组保存。
从原始读取、比对、过滤到标准化、热图、A/B区室和TAD，每一步都需要保留输入与版本。
预处理包括读取检查、连接序列处理、参考基因组比对、质量过滤、配对选择和去重。
区分原始计数、偏差校正、矩阵平衡、O/E矩阵和绘图颜色尺度。
DI描述局部接触方向，HMM或其他方法把连续信号转成候选边界。